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為探索和驗證lncRNA,Bio-Rad推出完整方案[新品推薦]

【字體: 時間:2018年04月04日 來源:生物通

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  Bio-Rad公司近日推出了IncRNA檢測流程,這是一種RT-qPCR的流程,專門針對lncRNA的定量進行優化,可帶來高度靈敏且特異的定量結果,適用于lncRNA的探索和驗證。

長鏈非編碼RNA(lncRNA)雖然不編碼蛋白質,但在多個層面上調控基因的表達水平,包括表觀遺傳調控、轉錄調控和轉錄后調控。因此,lncRNA如今也成為一個研究熱點。

不過,lncRNA的定量特別困難,因為它在某些發育階段或某些細胞類型中的表達水平很低。同時,lncRNA的引物設計又是一件費時費力的事,因為這些目標往往位于復雜的基因組位點,并形成二級結構。

為此,Bio-Rad公司近日推出了IncRNA檢測流程,這是一種RT-qPCR的流程,專門針對lncRNA的定量進行優化,可帶來高度靈敏且特異的定量結果,適用于lncRNA的探索和驗證。

Bio-Rad的lncRNA檢測流程提供了從實驗樣品到lncRNA數據分析所需的所有工具,包括PrimePCR lncRNA Assay、預設計的PrimePCR lncRNA Array、定制的PrimePCR lncRNA Array以及新穎的iScript Explore One-Step RT and PreAmp Kit。它有望解決lncRNA研究過程中最迫切的挑戰。

利用iScript Explore One-Step RT and PreAmp Kit,研究人員可以預擴增低豐度的lncRNA。對于材料有限的樣本來說,這是擴增目標的關鍵步驟。 單靠這一個試劑盒,研究人員就能夠進行基因組DNA消化、逆轉錄和預擴增。 通過專有的反應助推技術,即使是困難的目標也可以很容易地檢測到。

利用RNA-Seq來發現lncRNA的確很強大,但未免太過昂貴和耗時。Bio-Rad的20種預先設計的PrimePCR lncRNA Array覆蓋lncRNA研究的最活躍領域,包括癌癥、免疫學和干細胞研究等。預先設計的芯片經過專業審校,包括經常引用的lncRNA以及通過生物信息學分析發現的新穎lncRNA,以幫助您發現目標。

這種芯片可與Bio-Rad新推出的Preblended lncRNA PreAmp Assay Pools結合使用,后者包含了在相應的預設計芯片上預擴增目標所需的所有檢測,從而大大減少了手動設置時間。

對于那些已經確定了研究目標或者希望通過更多的樣品來驗證發現工作的研究人員,Bio-Rad的lncRNA檢測流程也提供了解決方案。定制的PrimePCR lncRNA Array可以在每塊芯片上設計10到384個lncRNA和mRNA目標。 如果需要,研究人員還可以在定制芯片中加入自行設計的單個檢測。

在數據分析方面,Bio-Rad也提供了強大的lncRNA表達分析軟件。CFX Maestro™軟件能夠簡化設計、數據采集和分析。PrimePCR分析軟件則允許非CFX實時定量PCR儀的用戶分析PrimePCR數據。(生物通 余亮)

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